Todo el proceso histórico que significó crear y mantener la Biblioteca Nacional del Ecuador determinó el acervo del Fondo Bibliográfico Ecuatoriano Republicano I comprendido en los años 1800 a 1950. A este fondo le pertenecen 12.331 ejemplares de obras publicadas por autores ecuatorianos durante este período; es uno de los fondos más requeridos por investigadores nacionales y extranjeros, pues conserva gran parte de información histórica del país. Dichos ejemplares destacan por su alto valor cultural, que se suman a las particularidades del soporte.
Un ejemplo a destacar es el título “Reflexiones sobre el contagio y trasmisión de las viruelas” por Francisco Eugenio Javier de Santacruz y Espejo en el que expuso un método seguro para preservar los pueblos de esta enfermedad.
Así también el facsímil de la publicación “Primicias de la Cultura de Quito” representa las ideas libertarias de la época y trató temas de ética y normas de higiene de la época; entre otros documentos históricos.
